MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI04

Total Repeats: 359

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021504	AAT	2	6	6	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657637
2	NC_021504	GAC	2	6	48	53	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512657637
3	NC_021504	A	6	6	109	114	100 %	0 %	0 %	0 %	512657637
4	NC_021504	GGAC	2	8	125	132	25 %	0 %	50 %	25 %	512657637
5	NC_021504	CTTC	2	8	182	189	0 %	50 %	0 %	50 %	512657637
6	NC_021504	T	6	6	240	245	0 %	100 %	0 %	0 %	512657637
7	NC_021504	CAA	2	6	381	386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657637
8	NC_021504	CCG	2	6	446	451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657637
9	NC_021504	ATC	2	6	457	462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657637
10	NC_021504	GGA	2	6	498	503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512657637
11	NC_021504	ATT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657637
12	NC_021504	GGA	2	6	606	611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512657637
13	NC_021504	GCG	2	6	615	620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512657637
14	NC_021504	TAT	2	6	649	654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657637
15	NC_021504	GATG	2	8	690	697	25 %	25 %	50 %	0 %	512657637
16	NC_021504	GCC	2	6	739	744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657637
17	NC_021504	GCG	2	6	789	794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512657637
18	NC_021504	TCTA	2	8	797	804	25 %	50 %	0 %	25 %	512657637
19	NC_021504	GA	3	6	855	860	50 %	0 %	50 %	0 %	512657637
20	NC_021504	TCCA	2	8	888	895	25 %	25 %	0 %	50 %	512657637
21	NC_021504	GACA	2	8	912	919	50 %	0 %	25 %	25 %	512657637
22	NC_021504	TGC	2	6	1034	1039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657637
23	NC_021504	GCT	2	6	1080	1085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657637
24	NC_021504	TTCT	2	8	1160	1167	0 %	75 %	0 %	25 %	512657637
25	NC_021504	T	6	6	1167	1172	0 %	100 %	0 %	0 %	512657637
26	NC_021504	GTT	2	6	1192	1197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657637
27	NC_021504	AGC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512657637
28	NC_021504	CCAT	2	8	1292	1299	25 %	25 %	0 %	50 %	512657637
29	NC_021504	GCC	2	6	1308	1313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657637
30	NC_021504	CATC	2	8	1328	1335	25 %	25 %	0 %	50 %	512657637
31	NC_021504	CTGT	2	8	1339	1346	0 %	50 %	25 %	25 %	512657637
32	NC_021504	TTA	2	6	1515	1520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657637
33	NC_021504	CGG	2	6	1538	1543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512657637
34	NC_021504	CTG	2	6	1603	1608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657637
35	NC_021504	TC	3	6	1617	1622	0 %	50 %	0 %	50 %	512657637
36	NC_021504	ATG	2	6	1667	1672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657637
37	NC_021504	CCA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512657637
38	NC_021504	A	7	7	1709	1715	100 %	0 %	0 %	0 %	512657637
39	NC_021504	CCCG	2	8	1744	1751	0 %	0 %	25 %	75 %	512657637
40	NC_021504	CCG	2	6	1863	1868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657637
41	NC_021504	GCC	2	6	1877	1882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657637
42	NC_021504	AGA	2	6	1907	1912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657637
43	NC_021504	AG	3	6	1985	1990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021504	ACA	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657638
45	NC_021504	GAA	2	6	2077	2082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657638
46	NC_021504	GGCA	2	8	2108	2115	25 %	0 %	50 %	25 %	512657638
47	NC_021504	GA	4	8	2128	2135	50 %	0 %	50 %	0 %	512657638
48	NC_021504	TAT	2	6	2179	2184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021504	TAT	2	6	2206	2211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021504	AAT	2	6	2212	2217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021504	A	6	6	2222	2227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021504	GCT	2	6	2267	2272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657639
53	NC_021504	TGC	2	6	2395	2400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657639
54	NC_021504	AAG	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657639
55	NC_021504	ATT	2	6	2429	2434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657639
56	NC_021504	TTC	2	6	2519	2524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512657639
57	NC_021504	CCG	2	6	2601	2606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657639
58	NC_021504	TGG	2	6	2776	2781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512657639
59	NC_021504	GCT	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657639
60	NC_021504	CGC	2	6	2956	2961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657639
61	NC_021504	GTT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657639
62	NC_021504	CTG	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657639
63	NC_021504	TAC	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657639
64	NC_021504	GTC	2	6	3024	3029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657639
65	NC_021504	TTG	2	6	3099	3104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657639
66	NC_021504	TTGG	2	8	3113	3120	0 %	50 %	50 %	0 %	512657639
67	NC_021504	AAGGT	2	10	3162	3171	40 %	20 %	40 %	0 %	512657639
68	NC_021504	ACA	2	6	3234	3239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657639
69	NC_021504	GTT	2	6	3242	3247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657639
70	NC_021504	GTT	2	6	3257	3262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657639
71	NC_021504	T	6	6	3338	3343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021504	AAT	2	6	3392	3397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021504	TAT	2	6	3409	3414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021504	TGT	2	6	3464	3469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021504	TAT	2	6	3486	3491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021504	T	7	7	3503	3509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021504	T	7	7	3539	3545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021504	CAAA	2	8	3716	3723	75 %	0 %	0 %	25 %	512657641
79	NC_021504	GAAT	2	8	3754	3761	50 %	25 %	25 %	0 %	512657641
80	NC_021504	AAAG	2	8	3823	3830	75 %	0 %	25 %	0 %	512657641
81	NC_021504	A	7	7	3888	3894	100 %	0 %	0 %	0 %	512657641
82	NC_021504	TAA	2	6	3901	3906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657641
83	NC_021504	A	6	6	3905	3910	100 %	0 %	0 %	0 %	512657641
84	NC_021504	CA	3	6	3967	3972	50 %	0 %	0 %	50 %	512657641
85	NC_021504	GAT	2	6	3995	4000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657641
86	NC_021504	TAA	2	6	4024	4029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657641
87	NC_021504	TTGA	2	8	4061	4068	25 %	50 %	25 %	0 %	512657641
88	NC_021504	GAAA	2	8	4147	4154	75 %	0 %	25 %	0 %	512657641
89	NC_021504	TAATT	2	10	4216	4225	40 %	60 %	0 %	0 %	512657641
90	NC_021504	AGAA	2	8	4236	4243	75 %	0 %	25 %	0 %	512657641
91	NC_021504	ATG	2	6	4244	4249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657641
92	NC_021504	A	6	6	4303	4308	100 %	0 %	0 %	0 %	512657641
93	NC_021504	CAT	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657641
94	NC_021504	TGT	2	6	4342	4347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657641
95	NC_021504	A	7	7	4371	4377	100 %	0 %	0 %	0 %	512657641
96	NC_021504	TAA	2	6	4378	4383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657641
97	NC_021504	GAT	2	6	4588	4593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657642
98	NC_021504	A	6	6	4607	4612	100 %	0 %	0 %	0 %	512657642
99	NC_021504	ATT	2	6	4655	4660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657642
100	NC_021504	AAT	2	6	4735	4740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657642
101	NC_021504	A	7	7	4797	4803	100 %	0 %	0 %	0 %	512657642
102	NC_021504	GAAT	2	8	4811	4818	50 %	25 %	25 %	0 %	512657642
103	NC_021504	TGA	2	6	4827	4832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657642
104	NC_021504	CAA	2	6	4838	4843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657642
105	NC_021504	T	6	6	4864	4869	0 %	100 %	0 %	0 %	512657642
106	NC_021504	ATG	2	6	4876	4881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657642
107	NC_021504	GAT	2	6	4888	4893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657642
108	NC_021504	AGTG	2	8	4928	4935	25 %	25 %	50 %	0 %	512657642
109	NC_021504	A	6	6	4973	4978	100 %	0 %	0 %	0 %	512657643
110	NC_021504	CA	3	6	5026	5031	50 %	0 %	0 %	50 %	512657643
111	NC_021504	AGT	2	6	5070	5075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657643
112	NC_021504	CAAATG	2	12	5134	5145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512657643
113	NC_021504	ATTTG	2	10	5171	5180	20 %	60 %	20 %	0 %	512657643
114	NC_021504	ATG	2	6	5206	5211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657643
115	NC_021504	A	6	6	5259	5264	100 %	0 %	0 %	0 %	512657643
116	NC_021504	AAC	2	6	5428	5433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657643
117	NC_021504	CAAAA	2	10	5443	5452	80 %	0 %	0 %	20 %	512657643
118	NC_021504	AAG	2	6	5472	5477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657643
119	NC_021504	TGAAAA	2	12	5534	5545	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	512657643
120	NC_021504	TTG	2	6	5619	5624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657643
121	NC_021504	ATA	2	6	5637	5642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657643
122	NC_021504	GAA	2	6	5647	5652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657643
123	NC_021504	AAAAGA	2	12	5657	5668	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	512657643
124	NC_021504	TTAA	2	8	5751	5758	50 %	50 %	0 %	0 %	512657643
125	NC_021504	GAA	2	6	5874	5879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657643
126	NC_021504	A	6	6	5938	5943	100 %	0 %	0 %	0 %	512657643
127	NC_021504	A	6	6	5999	6004	100 %	0 %	0 %	0 %	512657643
128	NC_021504	GAA	2	6	6012	6017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657643
129	NC_021504	ACTG	2	8	6062	6069	25 %	25 %	25 %	25 %	512657643
130	NC_021504	CAA	2	6	6222	6227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657643
131	NC_021504	CAA	2	6	6231	6236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657643
132	NC_021504	AAT	2	6	6239	6244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657643
133	NC_021504	A	6	6	6273	6278	100 %	0 %	0 %	0 %	512657643
134	NC_021504	CAA	2	6	6279	6284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657643
135	NC_021504	GAGTT	2	10	6289	6298	20 %	40 %	40 %	0 %	512657643
136	NC_021504	A	7	7	6331	6337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021504	CTTGT	2	10	6366	6375	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_021504	AAAG	2	8	6382	6389	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021504	TGG	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021504	TCT	2	6	6421	6426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021504	CA	3	6	6474	6479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021504	A	6	6	6482	6487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021504	TTA	2	6	6515	6520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021504	AT	4	8	6574	6581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021504	AAT	2	6	6591	6596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021504	A	6	6	6607	6612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021504	GATT	2	8	6614	6621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_021504	AGG	2	6	6676	6681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_021504	TA	4	8	7734	7741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021504	TCC	2	6	7815	7820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512657645
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259	NC_021504	CT	3	6	12072	12077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
260	NC_021504	CTGT	2	8	12089	12096	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
261	NC_021504	CT	3	6	12122	12127	0 %	50 %	0 %	50 %	512657650
262	NC_021504	CTG	3	9	12167	12175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657650
263	NC_021504	TCA	2	6	12179	12184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657650
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265	NC_021504	CAT	2	6	12329	12334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_021504	ATT	2	6	12761	12766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_021504	TTA	2	6	12767	12772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_021504	ATC	2	6	12781	12786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_021504	TA	3	6	12826	12831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_021504	TA	4	8	12834	12841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_021504	AT	4	8	12843	12850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_021504	TA	3	6	12852	12857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_021504	AT	4	8	12859	12866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_021504	ATA	2	6	12896	12901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_021504	AGG	2	6	12917	12922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
276	NC_021504	TTA	2	6	13078	13083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657651
277	NC_021504	CA	3	6	13094	13099	50 %	0 %	0 %	50 %	512657651
278	NC_021504	ATA	2	6	13150	13155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657651
279	NC_021504	ATT	2	6	13182	13187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657651
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284	NC_021504	TAA	2	6	13289	13294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657651
285	NC_021504	AAAT	2	8	13313	13320	75 %	25 %	0 %	0 %	512657651
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291	NC_021504	TCA	2	6	13688	13693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657651
292	NC_021504	CATA	2	8	13696	13703	50 %	25 %	0 %	25 %	512657651
293	NC_021504	ACT	2	6	13753	13758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657652
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299	NC_021504	ATA	2	6	14009	14014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657652
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301	NC_021504	A	6	6	14059	14064	100 %	0 %	0 %	0 %	512657652
302	NC_021504	TTA	2	6	14092	14097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_021504	CTG	2	6	14139	14144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_021504	TAA	3	9	14173	14181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_021504	T	6	6	14192	14197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_021504	CTT	2	6	14204	14209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
307	NC_021504	CAA	2	6	14219	14224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
308	NC_021504	AAT	2	6	14242	14247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_021504	GAA	2	6	14255	14260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
310	NC_021504	CCT	2	6	14261	14266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
311	NC_021504	GT	3	6	14281	14286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
312	NC_021504	ATT	2	6	14311	14316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_021504	CGG	2	6	14404	14409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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315	NC_021504	TATT	2	8	14492	14499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_021504	T	6	6	14506	14511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
317	NC_021504	TTA	2	6	14616	14621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_021504	T	6	6	14652	14657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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346	NC_021504	TCCC	2	8	15868	15875	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
347	NC_021504	TA	3	6	15882	15887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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357	NC_021504	ATC	2	6	16309	16314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
358	NC_021504	CTG	2	6	16336	16341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
359	NC_021504	GGA	2	6	16372	16377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.